|
|
Design počítačového tomografu
Bojková, Eva ; Lehocký, Peter (oponent) ; Zvonek, Miroslav (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá návrhem designu výpočetního tomografu (CT), což je lékařský přístroj, který slouží k určení diagnózy pacienta. Práce zkoumá a analyzuje současný stav a produkci těchto přístrojů. Následně je navržen nový design přístroje za dodržení zejména ergonomických, technických a estetických parametrů.
|
|
|
Příprava nanočástic a jejich využití jako kontrastních látek pro in vivo zobrazování.
Odehnalová, Nikola ; Kratochvílová, Irena (oponent) ; Turánek,, Jaroslav (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá optimalizací syntézy nanočástic zlata a následnou povrchovou modifikací umožňující jejich využití jakožto kontrastních látek pro in vivo zobrazování pomocí CT. Zlaté nanočástice byly připraveny Turkevichovou metodou a charakterizovány metodami TEM, DLS, MADLS a UV-Vis. Jejich povrch byl funkcionalizován polyethylenglykolem obsahujícím na jednom ze svých konců thiolovou skupinu, díky které se na povrch zlatých nanočástic vázal. Terminální konec řetězce daného polymeru byl pak methylovaný nebo zakončený aminoxy skupinou umožňující vznik oximové vazby s kyselinou hyaluronovou prostřednictvím klik-chemie. Způsobilost připravených nanočástic pro in vivo aplikaci byla ověřena na základě testů stability a cytotoxicity. Aplikační potenciál nanočástic zlata modifikovaných methylovaným polyethylenglykolem byl ověřen pomocí CT na myším modelu po intravenózním podání.
|
|
|
Přesná segmentace obrazových dat
Svoboda, Jan ; Marcoň, Petr (oponent) ; Mikulka, Jan (vedoucí práce)
Práce pojednává o tvorbě rozšiřujícího modulu pro platformu 3D Slicer. Jádro modulu je implementací klasifikátoru Support Vector Machines, jenž je využíván k segmentaci obrazových dat. Obrazová data byla poskytnuta lékaři z Fakultní nemocnice Brno Bohunice. Jedná se obrazové sekvence páteře pořízené pomocí dvou modalit, tedy výpočetní tomografie a magnetické rezonance. Cílem práce bylo tato data zpracovat, konkrétněji pak provést převzorkování, prostorové srovnání a následnou registraci. Obrazy pořízené výpočetní tomografií pak díky svému dostatečnému kontrastu poskytují autorům možnost lépe odhadnout segmentaci kostní tkáně od okolního prostředí i pro obrazy pořízené pomocí magnetické rezonance dosahujících menšího kontrastu. Pro kontrastní obrazy pořízené pomocí výpočetní tomografie bylo dosaženo odpovídajících výsledků, u predikovaných masek méně kontrastních obrazů se tento nedostatek projevil hrubými nepřesnostmi.
|
|
|
Využití programu Retomo pro tvorbu výpočtových modelů v biomechanice
Filková, Alena ; Lisický, Ondřej (oponent) ; Marcián, Petr (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá problematikou svalově kosterní biomechaniky. Přesněji tvorbou modelu geometrie vycházejícího z CT dat pomocí programu RETOMO a následně výpočtového modelu. Úvodní část je věnována stručnému vysvětlení pojmů výpočetní tomografie a metody konečných prvků. V následující kapitole je vypracovaná rešerše programů sloužících pro tvorbu modelů geometrie z CT dat v biomechanice. Dále se práce zabývá popisem vybraných funkcionalit a uživatelského prostředí programu RETOMO, přičemž je kladen největší důraz na tvorbu modelu geometrie z CT dat. Při realizaci bakalářské práce byly v analyzovaném programu vytvořeny dva modely geometrie, a to pomocí odlišných funkcí segmentace, které byly následně navzájem porovnány a poté porovnány i s modelem geometrie vytvořené v jiném programu. K porovnání odchylek geometrie jednotlivých modelů byl využit program GOM Inspect. Nakonec byly vytvořeny výpočtové modely za pomoci programu CATIA a následně provedena deformační a napěťová analýza pomocí programu ANSYS. Výsledky jednotlivých řešení byly navzájem analyzovány, porovnány a vyhodnoceny.
|
|
|
Identifikace 2D CT axiálních řezů pomocí konvolučních neuronových sítí
Vavřinová, Pavlína ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá klasifikací 2D axiálních CT řezů pacientských dat do šesti kategorií. K tomuto záměru byla využita oblast konvolučních neuronových sítí. Pro snadnější porozumění této problematice jsou nejprve vysvětleny základy neuronových sítí obecně a poté principy hlubokého učení zahrnující konvoluční neuronové sítě. Pro účely identifikace axiálních řezů byla vybrána konkrétně síť AlexNet, která byla po uzpůsobení otestovaná na vytvořené datové sadě. Celková úspěšnost klasifikace dosáhla 86%, po finálních úpravách došlo k mírnému zlepšení, kdy identifikační schopnost činila 87%.
|
|
|
Analýza časového vývoje léčených nádorů páteře v CT datech
Nohel, Michal ; Jan, Jiří (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá časovým vývojem léčených nádorů páteře v CT datech. V teoretické části se zabývá anatomií, fyziologií a patofyziologií páteře a těl obratlů. Dále popisuje diagnostické a terapeutické možnosti detekce a léčby nádorů páteře. Její součástí je přehled současného stavu využití časové analýzy v onkologii. Jsou diskutovány problémy dostupných anotací a jsou vytvořeny nové databáze pro následnou analýzu. Dále je navržena metodologie časové analýzy podle tvarové charakterizace a velikosti postižení obratle. Na vytvořené databáze jsou aplikovány navržené metodické přístupy extrakce příznaků. Jejich volba a vhodnost je diskutována, včetně jejich potenciálu pro případné využití pro klinickou praxi sledování vývoje a odvozování charakteristických závislostí příznaků na prognóze pacienta.
|
|
|
Metody detekce, segmentace a klasifikace obtížně definovatelných kostních nádorových lézí ve 3D CT datech
Chmelík, Jiří ; Flusser,, Jan (oponent) ; Kozubek, Michal (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Cílem této práce byl vývoj algoritmů pro detekci, segmentaci a klasifikaci obtížně definovatelných kostních metastatických nádorových lézí v oblasti páteře z obrazových CT dat. Pro tyto účely byla vytvořena pacientská databáze anotovaná lékařskými experty. Postupně byly navrženy tři metody, z nichž první je založena na přepracování a kombinaci metod dostupných z předchozího řešení projektu, druhá je velmi rychlá varianta založená na fuzzy k-means shlukové analýze, třetí metoda využívá moderních metod strojového učení, konkrétně hluboké učení konvolučních neuronových sítí. Dále byla navržena modifikace upřesňující výsledky následnou meta-analýzou nalezených kandidátů lézí pomocí náhodného lesa. Dosažené výsledky byly objektivně vyhodnoceny a porovnány s výsledky algoritmů publikovaných jinými autory. Pro hodnocení byly použity dva přístupy: technický, voxelově založený a klinický, objektově založený. Dosažené výsledky byly následně zhodnoceny a diskutovány.
|
|
|
Segmentace kortikálních částí obratlů
Janštová, Michaela ; Kolář, Radim (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Práce se zabývá segmentací kortikálních částí obratlů z CT obrazových dat v programovém prostředí MATLAB. Popsána je problematika segmentačních technik, zejména metody „level-set” a její modifikace DRLSE. Tato metoda byla zvolena na základě informací získaných z článků publikovaných v odborných časopisech a také díky hojnému využití v praxi a uspokojivým výsledkům právě v oblasti segmentace kostních tkání. V závěru práce je navržená metoda testovaná na CT obrazových datech.
|
|
|
Detekce a segmentace lumbálních obratlů v 3D CT datech
Nemček, Jakub ; Kolář, Radim (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Práca sa zaoberá detekciou a segmentáciou lumbálnych stavcov v CT obrazových dátach. Popísaná detekčná metóda je založená na používaní natrénovaného SVM klasifikátora a histogramoch orientovaných gradientov ako obrazových príznakoch. Detekcia je aplikovaná na dvojrozmerné sagitálne rezy CT obrazu. Segmentácia je realizovaná metódou deformovania trojuholníkových mriežkových modelov získaných zo spriemerovaných stavcov z reálnych CT dát. V prvej časti práce sú popísané potrebné teoretické poznatky o anatómii osového skeletu, počítačovej tomografii, metódach spracovania obrazu a o problematike detekcie a segmentácie. Druhá časť obsahuje postup realizácie algoritmov, ďalej vyhodnotenie a diskusiu výsledkov u detekčného a segmentačného algoritmu. Na záver je diskutované možné využitie algoritmov v CAD systémoch. Aplikácia všetkých praktických bodov je realizovaná v programovacom prostredí Matlab.
|
|
|
Akviziční a detekční geometrie CT RTG procesu zobrazení
Rusz, Jakub ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Drastich, Aleš (vedoucí práce)
V této práci jsou popsány komponenty akviziční a detekční geometrie 3. generace jednovrstvého CT skeneru. Dále se zabývá vysoko-kontrastním prostorovým rozlišením procesu zobrazení a jaký vliv mají parametry akviziční a detekční geometrie na limitní dosažitelné vysoko-kontrastní prostorové rozlišení. Součástí je program simulující tyto vlivy a návrh laboratorní úlohy s cílem tyto vlivy objasnit.
|
host ::
RSS.